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微量細(xì)胞核酸提取中常見的挑戰(zhàn)與解決方案

發(fā)布日期: 2025-09-08
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   在分子生物學(xué)研究、臨床診斷等領(lǐng)域,微量細(xì)胞核酸提取是關(guān)鍵前置步驟。然而,因樣本量極少(通常僅含幾十至幾百個(gè)細(xì)胞),提取過程面臨諸多挑戰(zhàn),直接影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性與可靠性,需針對(duì)性制定解決方案。
 
  微量細(xì)胞核酸提取首要挑戰(zhàn)是核酸得率低。微量細(xì)胞本身含有的核酸量極少,提取過程中不可避免的吸附損失、離心殘留等問題,會(huì)進(jìn)一步降低最終獲得的核酸量,難以滿足下游PCR、測(cè)序等實(shí)驗(yàn)對(duì)模板量的需求。對(duì)此,可采用優(yōu)化的提取試劑,如選擇吸附效率更高的硅基磁珠,其能在低濃度下特異性結(jié)合核酸,減少吸附損失;同時(shí)改進(jìn)提取流程,縮短離心時(shí)間、降低離心轉(zhuǎn)速,減少核酸在離心管壁的殘留,還可通過增加洗脫次數(shù)、提高洗脫溫度(如50-60℃),提升核酸洗脫效率,提高得率。
 
  核酸純度差是另一大難題。微量細(xì)胞樣本中,蛋白質(zhì)、多糖、脂質(zhì)等雜質(zhì)相對(duì)含量較高,提取時(shí)易與核酸共純化,干擾后續(xù)酶促反應(yīng)。為解決這一問題,需強(qiáng)化樣本預(yù)處理環(huán)節(jié),加入蛋白酶K可有效降解蛋白質(zhì),使用RNase抑制劑避免RNA降解;在純化階段,增加洗滌次數(shù),選用含胍鹽、乙醇的洗滌緩沖液,去除雜質(zhì);對(duì)于高雜質(zhì)樣本,可引入核酸純化柱二次純化,進(jìn)一步提高核酸純度。
 
  此外,樣本污染風(fēng)險(xiǎn)高也是微量細(xì)胞核酸提取中不可忽視的挑戰(zhàn)。微量核酸樣本極易受到外源性核酸(如環(huán)境中微生物核酸、操作人員攜帶的核酸)污染,且一旦污染,因樣本量少,污染核酸對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的干擾更為顯著。為防范污染,需建立嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)環(huán)境,在超凈工作臺(tái)或負(fù)壓生物安全柜中進(jìn)行操作,定期對(duì)實(shí)驗(yàn)臺(tái)面、儀器進(jìn)行消毒;使用無核酸酶的實(shí)驗(yàn)耗材和試劑,避免試劑本身攜帶污染;同時(shí)設(shè)置陰性對(duì)照(如空白提取試劑)和陽性對(duì)照,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)提取過程是否存在污染。
 
  針對(duì)微量細(xì)胞核酸提取中的得率、純度、污染等挑戰(zhàn),通過優(yōu)化試劑與流程、強(qiáng)化質(zhì)量控制,可有效提升核酸提取質(zhì)量,為后續(xù)科研與臨床應(yīng)用奠定堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。